En un mundo donde los mutantes son tanto temidos como perseguidos, surge una antigua amenaza que pone en jaque la supervivencia de la humanidad. Un poderoso mutante conocido como En Sabah Nur, el primer mutante, ha despertado tras siglos de letargo. Con la ambición de reinar sobre un mundo que considera inferior, empieza a reunir a un grupo de leales seguidores, entre ellos una joven y poderosa versión de Magneto, además de la temida Psíquica, entre otros.