En un mundo donde las criaturas gigantes han dejado una profunda huella en la humanidad, una nueva amenaza emerge del caos: un ser conocido como Destoroyah, una monstruosa manifestación del material peligroso creado por el propio Godzilla. Mientras el rey de los monstruos comienza a mostrar signos alarmantes de un colapso inminente en su organismo, un grupo de científicos intenta descubrir una forma de detener la destrucción inminente causada por esta nueva criatura.

En un mundo donde los kaijus son una constante amenaza, la humanidad decide tomar cartas en el asunto y crea a Mechagodzilla, una imponente máquina diseñada para enfrentar cualquier criatura que ponga en peligro la vida en la Tierra. Sin embargo, la calma se ve interrumpida cuando Godzilla, la icónica fuerza de la naturaleza, emerge de las profundidades del océano, algo más furioso que nunca.