En un giro inesperado de los eventos, Conan Edogawa y sus amigos se sumergen en un misterioso juego de realidad virtual que los lleva directamente a la Londres victoriana. La trama comienza cuando los chicos descubren un programa que les permite conectarse a un mundo inspirado en las novelas de Sherlock Holmes. Sin embargo, lo que parecía ser una divertida aventura se convierte en una pesadilla cuando un malvado fantasma, que se hace llamar "el espíritu de Baker Street", comienza a acecharlos dentro del juego.

En un futuro lejano, la humanidad ha expandido su territorio a través del espacio, pero las tensiones entre las distintas facciones aumentan. La historia sigue a Seabook Arno, un joven que vive en una pequeña colonia espacial y es un apasionado de la tecnología y la mecánica. Todo cambia cuando su pacífica vida se ve interrumpida por un ataque de los nefastos Crossbone Vanguard, un grupo rebelde decidido a conquistar el espacio. Durante este ataque, Seabook se enfrenta a la dura realidad de la guerra y se ve arrastrado al conflicto.