En un futuro no muy lejano, la humanidad se encuentra al borde de la extinción debido a la amenaza de diversos monstruos gigantes que han emergido de las profundidades del océano y de otros rincones del planeta. Un grupo de elite conocido como la Fuerza de Autodefensa se ha unido para combatir esta ola de destrucción, no solo con tecnología avanzada, sino también utilizando al emblemático monstruo que ha sido su hijo pródigo: Godzilla.

En un mundo donde los monstruos son más que una leyenda, la humanidad vive con la constante amenaza de Godzilla, la bestia más imponente del océano. Tras una aparición devastadora, un grupo de científicos y militares se une para investigar a fondo el fenómeno del monstruo. Pero no todo es lo que parece: un misterioso objeto espacial se acerca a la Tierra y los rumores sobre una nueva forma de vida alienígena comienzan a surgir.