Los agentes del FBI Mulder y Scully investigan la desaparición de varias mujeres en una población rural de Virginia. Siguiendo algunas pistas, descubren un experimento secreto que puede guardar relación con las desapariciones.

Unos amigos en un viaje de campamento descubren que el pueblo en el que están de vacaciones está siendo plagado de manera inusual por alienígenas parásitos del espacio exterior.

El geofísico Dr. Josh Keyes descubre que una fuerza desconocida ha causado que el núcleo interno de la tierra deje de girar. Con el campo magnético del planeta deteriorándose rápidamente, nuestra atmósfera literalmente comienza a desmoronarse con consecuencias catastróficas. Para resolver la crisis, Keyes, junto con un equipo de los científicos más dotados del mundo, viajan al corazón de la tierra. Su misión: detonar un dispositivo que reactive el núcleo.