En una remota isla del Pacífico, la joven Nim, quien vive con su padre en un pequeño refugio, lleva una vida llena de aventuras. Su hogar es un verdadero paraíso natural donde se siente libre, rodeada de sus amigos: un simpático iguana, un león marino y una tortuga. Sin embargo, su mundo se trastoca cuando su padre desaparece durante una expedición en busca de investigación científica. Desesperada y sin la ayuda de los adultos, Nim se siente sola y perdida, pero encuentra consuelo en las historias de su libro favorito, protagonizado por un valiente e intrépido aventurero.

En esta divertida aventura mochilera, un grupo icónico de amigos y sus fieles acompañantes de pelaje, se encuentran en un punto crítico. Tras una serie de misteriosos eventos que llevaron a su separación, Mystery Inc. ha decidido tomarse un merecido descanso en un luxoso resort en una isla tropical. Pero, claro, las cosas no pueden ser tan simples. Cuando un antiguo enemigo misterioso comienza a asustar a los turistas con espectros aterradores, el equipo se ve obligado a unirse nuevamente para resolver el enigma.