En un mundo donde la realidad es solo una simulación creada por máquinas, Neo, el Elegido, se encuentra en una constante lucha por liberar a la humanidad de la opresión digital. Después de haber despertado a la verdad sobre la Matrix, se une a sus compañeros de resistencia, Morfeo y Trinity, quienes están decididos a desmantelar el sistema que controla sus vidas. Sin embargo, el tiempo se agota. Las máquinas están preparando un ataque masivo contra Zion, la última ciudad de los humanos, y su destino se torna cada vez más incierto.