En esta emocionante secuela, nos reencontramos con Jesse, un adolescente que ha logrado forjar un vínculo especial con Willy, la orca que rescató en su anterior aventura. Todo parece ir bien, hasta que su vida da un giro inesperado cuando la madre de Jesse le propone un viaje a una remota isla en el Pacífico, donde se lleva a cabo una fiesta de verano. Sin embargo, el espíritu de diversión se ve rápidamente opacado por una amenaza real: un grupo de cazadores furtivos que planean capturar a Willy y a otros animales marinos para venderlos.