En un futuro no muy lejano, la tripulación del USS Enterprise, liderada por el carismático capitán James T. Kirk, se encuentra en un intenso conflicto entre la lealtad y la justicia. Tras un ataque devastador que sacude la base estelar de la Flota Estelar, Kirk se ve obligado a desobedecer las órdenes y asumir una misión casi suicida en un mundo en guerra. La aparición de un misterioso y temido enemigo, John Harrison, pone a prueba no solo la valentía de Kirk, sino también los lazos que unen a su tripulación.