En un Japón post-siglo XIX, donde las antiguas tradiciones luchan por sobrevivir en medio de la modernidad, un espadachín errante busca redimirse de su pasado violento. Kenshin Himura, una leyenda conocida como el “Asesino Battōsai”, ha dejado atrás su vida como guerrero para vivir en paz. Sin embargo, sus días tranquilos se ven interrumpidos cuando se enfrenta a un nuevo enemigo: un poderoso y corrupto arquitecto del nuevo orden japonés, Makoto Shishio, que busca imponer su propia visión de la nación con una serie de atentados terribles.

En una Tokyo moderna, un grupo de personas que han muerto de forma repentina se encuentra atrapado en un juego siniestro que desafía las leyes de la vida y la muerte. Entre ellos están Kei Kurono, un joven egoísta y solitario, y su antiguo compañero de escuela, Masaru Kato, quien trata de mantener la esperanza en medio del caos. Pronto descubren que están siendo controlados por una esfera negra, que les obliga a participar en misiones extremadamente peligrosas donde deben combatir a alienígenas aterradores para ganar puntos y, quizás, la oportunidad de revivir o obtener libertad.