En un mundo donde los humanos y los animales han dejado de comunicarse, un excéntrico doctor que tiene la habilidad de hablar con los animales vive recluido en su magnífico pero descuidado hogar. Tras la muerte de su esposa, el hombre se ha cerrado al mundo, prefiriendo la compañía de sus peculiares amigos peludos y plumosos. Sin embargo, su tranquila vida se ve interrumpida cuando el reino se entera de que la reina está gravemente enferma.

En un rincón mágico de Nunca Jamás, las hadas de la Tierra de las Hadas viven en armonía, cada una cumpliendo su rol en la creación de la naturaleza. Sin embargo, todo cambia cuando una hada aventurera llamada Zarina, consumida por su curiosidad y deseo de explorar, decide robar el polvo de hada de la Reina Clarion y unirse a un grupo de piratas. Zarina pronto se convierte en la mano derecha de un astuto capitán, pero su traición deja a las hadas en un problema monumental.

En esta divertida y deliciosa secuela, Flint Lockwood, el inventor más ingenioso de la ciudad de Swallow Falls, se enfrenta a una nueva y sabrosa aventura. Después de que su invento más famoso, la máquina que transforma el agua en comida, causara un desastre gigantesco al convertir la isla en un festín descontrolado, las autoridades deciden destruirla. Sin embargo, la historia no termina ahí; Flint y sus amigos descubren que su máquina aún está en funcionamiento y ha creado una isla de auténticas criaturas comestibles.