Después de escapar del aterrador Laberinto, Thomas y sus amigos creen que han dejado atrás el peligro y la confusión. Sin embargo, pronto descubrirán que su lucha por la libertad apenas ha comenzado. Adentrándose en un mundo desolado conocido como "El Quemador", los chicos se enfrentan a un paisaje inhóspito repleto de tormentas de arena, criaturas mutantes y un grupo misterioso que tiene sus propios planes oscuros.