La historia sigue a Laura, una psicóloga que, después de haber sobrevivido a los aterradores eventos de la primera película, intenta reconstruir su vida y dejar atrás las horribles experiencias que la marcaron. Sin embargo, su paz es efímera cuando empieza a recibir mensajes inquietantes de sus pacientes, quienes afirman haber sido atormentados por una presencia oscura y aterradora.

En un futuro no muy lejano, la humanidad ha empezado a colonizar planetas más allá de su sistema solar. Una de las nuevas colonias, Romulus, se presenta como un paraíso de esperanza y tecnología avanzada. Sin embargo, la situación se torna oscura cuando un grupo de colonos, liderados por la teniente Sarah Turner, comienza a experimentar extraños fenómenos e inexplicables desapariciones. Mientras investigan, descubren una antigua nave alienígena enterrada en el planeta, y lo que encuentran en su interior desata una fuerza que creían solo existía en las pesadillas.