En un futuro no muy lejano, la humanidad enfrenta una amenaza extraterrestre que podría llevar al planeta al borde de la destrucción. Un misterioso planeta, que aparece repentinamente en la órbita terrestre, es en realidad un nuevo hogar para una raza alienígena con intenciones bastante siniestras. Estos seres, conocidos como los Goras, desatan una serie de catástrofes naturales y se introducen en la vida de los humanos, sembrando el caos a su paso.

En esta secuela emocionante, Japón enfrenta de nuevo la amenaza de un gigantesco monstruo que surge de las profundidades del océano. Después de la devastación causada por el legendario titán, los habitantes de una ciudad costera intentan reconstruir sus vidas, pero la paz es interrumpida cuando un nuevo monstruo, más feroz y destructor que el anterior, emerge de la oscuridad. Este monstruo, un joven Godzilla, despierta su furia al ser desafiado por un nuevo enemigo enroscado en la historia local.