En una remota y misteriosa isla, el equilibrio del mundo se ve amenazado cuando un grupo de exploradores descubre un antiguo secreto que despierta la furia de criaturas gigantes. Entre estas bestias, un joven Godzilla se muestra como el héroe accidental de esta historia. Mientras su padre, el poderoso Godzilla, sigue siendo la leyenda que todos temen, es su hijo el que debe enfrentarse a un rival formidable: un monstruo de la antigüedad que ha estado dormido durante siglos.

En una pequeña isla del Pacífico, los habitantes llevan una vida tranquila, pero todo cambia cuando una serie de fenómenos extraños comienzan a ocurrir. La actividad sísmica se intensifica de repente y del interior de la isla emerge un antiguo monstruo, enorme y aterrador. Este coloso resulta ser una especie de pterodáctilo gigante, una criatura de leyenda que aterriza sobre la isleña población, arrasando todo a su paso.