En un mundo donde la paz parece frágil, la humanidad se enfrenta a una amenaza que nació del fondo del océano. Un joven inventor llamado Gengo es el encargado de proteger a su hermano sordo, quien tiene una conexión especial con el sonido. Mientras Gengo trabaja en su revolucionaria máquina submarina, un extraño mensaje llega de una civilización bajo el agua: una raza de seres marinos está en apuros. Estos habitantes de la tierra de Seatopia han sido atacados por un monstruo gigantesco que desea arrasar su hogar.

En un mundo convulso de la Guerra Fría, un misterioso submarino japonés llamado "Ayu" se embarca en una misión desesperada cuando varias naciones comienzan a reportar ataques de criaturas marinas gigantes. Estos monstruos no solo amenazan la seguridad de las costas, sino que también parecen estar vinculados a un antiguo artefacto que ha sido descubierto en el fondo del océano.

En un futuro no muy lejano, la humanidad enfrenta una amenaza extraterrestre que podría llevar al planeta al borde de la destrucción. Un misterioso planeta, que aparece repentinamente en la órbita terrestre, es en realidad un nuevo hogar para una raza alienígena con intenciones bastante siniestras. Estos seres, conocidos como los Goras, desatan una serie de catástrofes naturales y se introducen en la vida de los humanos, sembrando el caos a su paso.