En un mundo donde la humanidad depende de la ciencia para sobrevivir, un experimento militar despierta a un antiguo y temible enemigo. Un monstruo colosal, conocido como Jaiger, emerge de las profundidades del océano, sembrando el terror a su paso. Este ser, con habilidades mutantes que desafían la lógica, causa estragos en varias ciudades, dejando a su paso destrucción y caos. Ante esta inminente amenaza, la humanidad se ve obligada a recurrir a su último recurso: Gamera, la tortuga gigante y protector de la Tierra.