En un futuro no muy lejano, el mundo está bajo la influencia de un malvado ser intergaláctico conocido como el Emperador de la Cosa. Este villano ha desatado un peligroso rayo de descomposición que amenaza con acabar con la humanidad. En medio de este caos, Flesh Gordon, un carismático héroe musculoso y lleno de desparpajo, se convierte en la única esperanza de la Tierra. Junto a su ingenioso compañero, el Dr. Flex, y la irresistible Dale Ardor, nuestro héroe se embarca en una misión que lo llevará a través del espacio y el tiempo.