En un futuro no muy lejano, la USS Enterprise, la nave estelar más emblemática de la Federación, vuelve a estar en acción para hacer frente a una misteriosa amenaza que se dirige hacia la Tierra. Un gigantesco y enigmático artefacto espacial ha destruido todo lo que se encuentra a su paso y avanza a una velocidad imparable. Ante esta crisis, el almirante James T. Kirk, ahora en retiro, se ve obligado a retomar el mando de la Enterprise, donde se reunirá con viejos conocidos como el Vulcano Spock, quien lucha con su propia identidad y emociones.

En un pequeño pueblo de Arizona, la vida transcurre apaciblemente hasta que un misterioso fenómeno comienza a afectar a la población. Una serie de muertes inexplicables sacude la tranquilidad del lugar, y todo apunta a un populoso grupo de arañas que, tras ser perturbadas de su hábitat natural, desatan su furia. Un veterinario local, el Dr. Robert "Rack" McClintock, interpretado por un carismático William Shatner, intenta desentrañar el misterio detrás de estas criaturas, que parecen tener un comportamiento inusualmente agresivo.