En un Japón devastado por la guerra, un joven llamado Gen vive su vida entre la pobreza y la esperanza. La historia comienza en Hiroshima, donde la vida cotidiana de Gen se ve interrumpida por el estallido de la bomba atómica en agosto de 1945. Al hijo de una familia humilde, la tragedia le arrebata todo lo que ama: su hogar, su madre y su inocencia. A medida que intenta sobrevivir en un mundo lleno de destrucción y sufrimiento, Gen se enfrenta a la lucha diaria por la supervivencia, viviendo en medio de un paisaje apocalíptico lleno de residuos radiactivos y cenizas.

En un futuro distante, donde los humanos han alcanzado las estrellas, nos encontramos con un joven llamado Tetsuro, que vive en un mundo donde la humanidad se ha vuelto casi robótica. Después de perder a su madre en un trágico accidente, su vida toma un rumbo inesperado cuando decide embarcarse en un viaje a bordo de un tren espacial que surca la galaxia. Su objetivo: encontrar el misterioso planeta donde se promete la vida eterna, donde las personas pueden convertirse en máquinas.