En una noche oscura y llena de misterio, Scooby-Doo y la pandilla se ven involucrados en una aventura espeluznante que los lleva a Europa. Cuando el famoso cazador de monstruos, el Conde Dracula, hace un intento desesperado por mantener su título como el rey de los monstruos, decide convertir a Shaggy en un hombre lobo para participar en una carrera de monstruos. La única manera de romper la maldición es ganar la carrera, y el tiempo corre en su contra.

En un alocado encuentro entre el pasado y el futuro, los icónicos personajes de los Jetsons y los Flintstones se ven arrastrados a una aventura inesperada cuando un invento de George Jetson, un moderno viajero del tiempo, va horriblemente mal. Mientras intenta probar un nuevo dispositivo diseñado para facilitar la vida en su hogar futurista de Orbit City, un fallo en la tecnología lo transporta accidentalmente a la época de los cavernícolas, donde conoce a Pedro y Vilma Flintstone.

Cuando la pandilla de Mystery Inc. se embarca en una nueva aventura, termina en una mansión embrujada que pertenece a un anciano aventurero. Tras la muerte del propietario, Scooby-Doo y sus amigos son convocados para reclamar una herencia inesperada: la casa. Sin embargo, el viaje se convierte en un verdadero desafío cuando descubren que la mansión está habitada por tres cómicos fantasmas, conocidos como los Boo Brothers, que no tienen intención de dejar que nadie se quede.

En un tranquilo parque nacional, el famoso oso Yogi y su inseparable amigo Boo Boo se preparan para disfrutar de su primera Navidad. Sin embargo, su plan de robar unas deliciosas cestas de picnic se desbarata cuando descubren que el parque va a ser invadido por un grupo de humanos que planean celebrar las fiestas en su hábitat. En medio de tanto alboroto, Yogi decide que tiene que hacer algo para proteger su hogar y la alegría de una aventura navideña.

En la tranquila ciudad de Bedrock, la vida de los Flintstone avanza con su habitual normalidad, hasta que un misterioso y gótico grupo de personajes hace su aparición. El famoso Drácula, acompañado de su torpe asistente Frankenstone, llega a la ciudad con planes de construir un castillo en el que pueda llevar a cabo sus oscuros experimentos. A primera vista, la familia Flintstone no se percata de la amenaza que representan estos nuevos vecinos, pero pronto se dan cuenta de que su hogar está en peligro.

Un día cualquiera, en el mundo lleno de misterio y aventuras de la pandilla de los Misterios S.A., Scooby-Doo y sus amigos reciben una oferta increíble: ¡una oportunidad para convertirse en estrellas de cine! La historia comienza cuando un famoso productor de Hollywood se interesa en la pandilla tras conocer su increíble habilidad para resolver misterios. Decididos a aprovechar esta ocasión, Scooby, Shaggy, Velma, Daphne y Fred se dirigen a la ciudad de las estrellas, donde la vida es tan glamorosa como aterradora.