Dos chicas jóvenes, Mei y Satsuki, se mudan a una nueva casa cerca del hospital en el que se encuentra su madre. En el patio junto a la casa ,existe un gran árbol que es el hogar de tres Totoros, dioses de la selva. Poco después, reciben noticias desde el hospital de que su madre no puede venir a casa como había prometido, por lo que Mei (la más joven) se escapa para ir a visitarla. Satsuki tiene que recurrir a un Totoro para ayudar a encontrarla.
En un futuro donde la humanidad se ha desplazado al espacio, la Paz de la Tierra se ve amenazada por la tiranía del Principado de Zeon, que busca independencia a través de la guerra. La historia sigue a Amuro Ray, un joven piloto que, sin quererlo, se convierte en el guerrero clave en esta lucha. Después de que su colonia es atacada, Amuro se encuentra con un gigantesco robot de combate conocido como Gundam, un arma avanzada creada por la Federación Terrana.
En un universo devastado por la guerra, la lucha entre la Federación Terrestre y el Imperio Zeon continúa, dejando a su paso un rastro de destrucción y tragedia. La historia sigue a Amuro Ray, un joven piloto de mechas que se ve atrapado en el conflicto. Amuro ha crecido desde su primera batalla y ahora enfrenta no solo a sus enemigos, sino también sus propios demonios internos.