Cuando Sam Flynn, programador experto en tecnología de 27 años e hijo de Kevin Flynn, investiga la desaparición de su padre, se encuentra de repente inmerso en un peligroso y salvaje mundo surreal donde existen feroces luchas a muerte, un lugar paralelo donde su padre ha estado viviendo durante 25 años. Con la ayuda de una joven, padre e hijo se embarcarán en un viaje a vida o muerte a través de un universo cibernético, que con el tiempo se ha convertido en mucho más avanzado y peligroso... Secuela del clásico de culto de 1982.
Como Kevin Flynn busca la prueba que inventó un videojuego de éxito, es «digitalizado» por un láser y se encuentra dentro de La Rejilla, donde los programas sufren según la regla tiránica del Programa de control del Maestro. Con la ayuda de TRON, un programa de seguridad, Flynn procura liberar La Rejilla del MCP.