Luffy y sus amigos comienzan su viaje en un bosque que está lleno de monstruos, pero de repente Nami desaparece, dejando un mensaje, y el inicio del equipo en busca de ella, ¿podrán encontrarla o no..? 20 años después de su huida de Impel Down, el legendario pirata Shiki, el León Dorado, quien perdió una batalla contra Gol D. Roger, vuelve a aparecer causando agitación masiva a los marines. Durante su larga reclusión, fue capaz de encontrar un plan para someter al Gobierno Mundial de rodillas.
Tres historias de animación manga, basadas en tres historias gráficas cortas del maestro Katsuhiro Ôtomo, creador de "Akira": - Rosa Magnética (dirigida por Koji Morimoto) está basada en un manga de Otomo, en el que dos astronautas, siguiendo una señal de auxilio, son arrastrados al mundo fantástico creado por los recuerdos de una mujer. - Bomba Fétida (dirigida por Tensai Okamura) es la historia de un joven químico que se transforma por accidente en un arma biológica imparable que se encamina directamente a Tokyo.