En un futuro cercano, el planeta Tierra enfrenta una inminente catástrofe. Una misteriosa sonda alienígena está perturbando la atmósfera, causando estragos en la vida en el planeta. La tripulación del USS Enterprise, liderada por el capitán Kirk, se da cuenta de que la única solución para salvar a su hogar es viajar de regreso en el tiempo a la década de 1980. Su misión: encontrar a las ballenas jorobadas, ya que la sonda está intentando comunicarse con estas majestuosas criaturas, extintas en su era.