En un mundo donde los Pokémon y los humanos coexisten en armonía, Ash Ketchum y sus amigos, Misty y Brock, se embarcan en una nueva aventura que los lleva a un misterioso mundo paralelo. Todo comienza cuando la ciudad de Ecruteak es atacada por un poderoso Pokémon legendario: Entei, el Rey de la Torre Crystals. Pero este no es solo un simple ataque; Entei ha secuestrado a la madre de Ash, lo que desencadena una misión de rescate épica.