La historia arranca justo donde terminó la entrega anterior, con el detective Eric Matthews mientras enfrenta las consecuencias devastadoras de su encuentro con Jigsaw. Mientras el caos se desata tras la muerte de Matthews, el juego macabro continúa con un nuevo grupo de víctimas. Ahora, el nuevo protagonista es un forense, la Dra. Lynn Denlon, quien se ve atrapada en la retorcida red de manipulaciones de Jigsaw. Lo que comienza como un simple reconocimiento de una escena del crimen se convierte en una lucha desesperada por la supervivencia.

En medio de una celebración a bordo de un poderoso acorazado, un grupo de terroristas altamente entrenados, liderados por un implacable ex-agente de la CIA, toma el control del barco, dejando a la tripulación y a los altos mandos en un estado de incertidumbre y pánico. Sin embargo, no contaban con que en el interior del buque se encontrara un viejo ex-SEAL de la Marina, quien es el chef del barco. Este ex-soldado, acostumbrado a lidiar con situaciones extremas, se convierte en la única esperanza para recuperar el control y salvar a los rehenes.