Cuando una serie de asesinatos impactan a la ciudad, Conan Edogawa se ve arrastrado a una trama oscura llena de misterio y peligro. Todo comienza con la aparición de una bella joven llamada Shiho Miyano, quien posee un enigmático pasado vinculado a la organización secreta conocida como la "Organización Negra". Al mismo tiempo, un nuevo asesino ha comenzado a eliminar un listado de personas misteriosas, y lo único que se interpone entre él y sus objetivos es Conan, que lucha por descubrir la verdad antes de que más vidas se pierdan.

En una soleada mañana en la ciudad, un grupo de amigos celebra un competitivo torneo de tiro al plato. Sin embargo, la diversión pronto se ve interrumpida cuando una serie de asesinatos comienza a ocurrir, cada uno dirigido a un joven del grupo. A medida que el pánico se desata entre los participantes, nuestro astuto protagonista, un adolescente con un gran talento para resolver misterios, se ve envuelto en un enigma cada vez más oscuro.

En un futuro cercano, un grupo de humanos lucha por mantener su identidad en un mundo dominado por la tecnología y la manipulación de los recuerdos. La historia sigue a un joven ingeniero llamado Ibe, quien se encuentra atrapado entre sus deberes laborales y sus propios dilemas morales. Cuando empieza a trabajar en una revolucionaria empresa que se especializa en la modificación de recuerdos, Ibe se da cuenta de que su vida está a punto de dar un giro inesperado.

En un mundo lleno de magia y criaturas míticas, un habilidoso ninja llamado Bōsō se convierte en el blanco de una peligrosa persecución. Tras haber sido traicionado por su propio clan, se encuentra atrapado en una oscura trama de venganza y poder. Con un talento excepcional para la lucha, Bōsō es tanto un guerrero legendario como un hombre marcado por su pasado. Su búsqueda de redención lo lleva a cruzar caminos con una enigmática mujer, quien oculta secretos que podrían cambiar el rumbo de su existencia.