En una cálida tarde de verano, un grupo de amigos adolescentes que aún están en la escuela secundaria se cruzan accidentalmente en el instituto de una misteriosa institución: el Museo de Mysterios. Scooby-Doo, un gran danés siempre hambriento y su mejor amigo, Shaggy, son los epicentros del alboroto, mientras que Fred, Daphne y Velma se unen a la aventura. Juntos, deciden investigar una serie de fenómenos extraños que han comenzado a acontecer en su escuela, incluida la misteriosa desaparición de varias pertenencias valiosas.

En un futuro cercano, el enigmático viajero del tiempo, conocido como el Doctor, se encuentra atrapado en el turbulento destino de su propio pasado. La historia comienza en San Francisco, donde el Doctor, un humanoide del planeta Gallifrey con la capacidad de regenerarse, se enfrenta a un nuevo y temible enemigo: los Maestros de la Oscuridad. Mientras el Doctor intenta evitar una catástrofe intergaláctica, es capturado y herido mortalmente por sus enemigos.

En una ciudad vibrante y caótica, un arquitecto de éxito lleva una vida aparentemente perfecta, pero su corazón está dividido entre dos mujeres que representan facetas opuestas de su vida. Por un lado está su esposa, una mujer estable y sensata que lo ha apoyado incondicionalmente a lo largo de su carrera, pero que también representa la rutina y la conformidad. Por otro lado, surge una amante audaz y apasionada que despierta en él una chispa de emoción y deseo que parecía haber desaparecido hace mucho tiempo.