Chris Redfield reclama la ayuda de Leon S. Kennedy y Rebecca Chambers para impedir que un mercader de la muerte, con ánimo de venganza, propague un virus mortal en Nueva York.
Tras los acontecimientos relatados en “Kenshin, el guerrero samurai”, Kenshin Himura vive retirado, fiel a su juramento de no volver a empuñar la espada; pero la aparición de un misterioso villano que amenaza con derrocar al gobierno hará que el protagonista replantee su postura. Rurôni Kenshin: Kyoto taika-hen es el primer segmento del espectacular díptico que concluirá las aventuras del guerrero.