En una tranquila y mágica aldea, Natsume Takashi sigue lidiando con su peculiar don: la habilidad de ver espíritus y youkais que se esconden a simple vista. Después de una serie de encuentros emotivos y a menudo nostálgicos con estos seres, Natsume se encuentra en una encrucijada. Mientras se esfuerza por hacer su vida cotidiana lo más normal posible, su conexión con el mundo sobrenatural no disminuye.

En un caluroso día en Tokio, la vida de los ciudadanos se ve interrumpida cuando un misterioso monstruo comienza a emerger del océano. Aparece de repente, dejando caos y destrucción a su paso, mientras la ciudad entra en pánico. Los funcionarios del gobierno, que inicialmente desestiman la amenaza, pronto se ven obligados a enfrentar la cruda realidad: un antiguo terror ha despertado y está decidido a arrasar con todo.

En un reino japonés de tiempos antiguos, un humilde leñador descubre una extraña y brillante planta en el bosque. Al cortarla, se sorprende al encontrar dentro a una hermosa niña. Decidiendo adoptarla, la lleva a casa y la nombra Kaguya. A medida que crece, Kaguya se transforma en una joven extraordinaria, cuya belleza cautiva a todos los que la conocen. Sus padres, llenos de amor y orgullo, intentan encontrarle un futuro grandioso, pero Kaguya se siente atrapada en un mundo que no comprende.