En una tranquila y mágica aldea, Natsume Takashi sigue lidiando con su peculiar don: la habilidad de ver espíritus y youkais que se esconden a simple vista. Después de una serie de encuentros emotivos y a menudo nostálgicos con estos seres, Natsume se encuentra en una encrucijada. Mientras se esfuerza por hacer su vida cotidiana lo más normal posible, su conexión con el mundo sobrenatural no disminuye.
Todo se complica cuando Natsume recibe un misterioso libro que pertenece a un antiguo youkai que ha sido olvidado por el tiempo. Este libro no solo contiene secretos sobre el pasado de Natsume, sino que también revela oscuros eventos que podrían alterar el delicado equilibrio entre humanos y espíritus. A medida que profundiza en estas nuevas revelaciones, Natsume se siente abrumado por la responsabilidad que conlleva su descubrimiento.
con la ayuda de su inseparable amigo Madara, un espíritu en forma de gato, y otros aliados inesperados, Natsume necesita desentrañar los secretos ocultos y descubrir su propio lugar en este mundo mágico. La búsqueda de respuestas le llevará a confrontar no solo los fantasmas del pasado, sino también su propia identidad y el verdadero significado de la amistad. En un viaje cargado de emociones, Natsume tendrá que elegir entre su deber hacia los espíritus y su deseo de vivir una vida normal, mientras aprende que los lazos que forjamos pueden ser tan fuertes como los lazos de sangre.