En una tranquila y mágica aldea, Natsume Takashi sigue lidiando con su peculiar don: la habilidad de ver espíritus y youkais que se esconden a simple vista. Después de una serie de encuentros emotivos y a menudo nostálgicos con estos seres, Natsume se encuentra en una encrucijada. Mientras se esfuerza por hacer su vida cotidiana lo más normal posible, su conexión con el mundo sobrenatural no disminuye.