En un mundo donde la tecnología y la naturaleza chocan de formas sorprendentes, el equilibrio entre humanos y monstruos se ve amenazado una vez más. Después de la victoria de Godzilla sobre sus enemigos anteriores, una nueva amenaza emerge de las sombras: un Mechagodzilla, una versión robótica del legendario monstruo, que ha sido diseñado por una misteriosa fuerza extraterrestre. La brillante pero despiadada inteligencia detrás de este proyecto tiene como objetivo conquistar la Tierra, utilizando a Mechagodzilla como su arma definitiva.

En un futuro no muy lejano, la humanidad enfrenta una amenaza extraterrestre que podría llevar al planeta al borde de la destrucción. Un misterioso planeta, que aparece repentinamente en la órbita terrestre, es en realidad un nuevo hogar para una raza alienígena con intenciones bastante siniestras. Estos seres, conocidos como los Goras, desatan una serie de catástrofes naturales y se introducen en la vida de los humanos, sembrando el caos a su paso.

En una mystérieosa isla, un grupo de exploradores descubre un antiguo templo donde se encuentra un huevo gigante. Pronto, son arrastrados a un mundo de maravillas y peligros cuando el huevo se abre, revelando a una diminuta criatura con un potencial asombroso. Sin embargo, la felicidad es efímera, ya que una poderosa corporación, ansiosa por aprovechar la fuerza de la naturaleza, roba el huevo y lo lleva a la ciudad de Tokio. Sin darse cuenta de las consecuencias devastadoras de su codicia, desatan una cadena de eventos que traerán caos a la capital japonesa.

En un Japón feudal en crisis, una aldea agrícola vive con el constante temor de sufrir el asalto de una banda de bandidos. Desesperados y sin opciones, los aldeanos deciden tomar el asunto en sus propias manos y buscan ayuda. Tras varias idas y venidas, logran contratar a un grupo de siete guerreros, cada uno con habilidades únicas y personalidades distintas, que están dispuestos a defenderlos.

En el corazón de Tokio, un burócrata de mediana edad llamado Kanji Watanabe vive una vida monótona y gris, sumido en el tedio de la burocracia. Su rutina se ve sacudida cuando recibe la devastadora noticia de que padece una enfermedad terminal. Este golpe lo lleva a una profunda reflexión sobre el significado de su existencia. Anticipando su muerte, Watanabe se da cuenta de que ha pasado su vida sin realmente vivirla, y se embarca en un viaje personal de redescubrimiento.