En un Japón donde el misterio y la magia se entrelazan con la realidad, seguimos la historia de una joven llamada Suzume, quien vive una vida tranquila en un pequeño pueblo. Un día, se encuentra con un extraño, un viajero que le habla de puertas que conectan diferentes mundos. Intrigada y algo escéptica, Suzume sigue al misterioso chico, y juntos descubren una serie de puertas antiguas que, si se dejan sin cerrar, pueden desatar fuerzas destructivas en el mundo.