En una ciudad llena de caos y criminales, tres pequeñas heroínas sobreviven al desafío de la vida diaria. Buttercup, la ruda de corazón fuerte; Bubbles, la dulce y sensible; y Blossom, la líder confiada, han sido creadas a partir de una mezcla de azúcar, especias y todo lo que es bueno. Sin embargo, su apacible existencia en Townsville se ve amenazada cuando un villano de lo más extraño, el profesor Utonium, se convierte en su principal adversario. Este científico no es otro que Mojo Jojo, un simio que está obsesionado con demostrar que puede vencer a las chicas y dominar la ciudad.
Cuando sus intentos de sabotear a las Powerpuff Girls no resultan como esperaba, Mojo Jojo se obsesiona y lanza un ataque sin precedentes en el que prácticamente las chicas son acusadas de ser un peligro para la ciudad. Atrapadas en un torbellino de confusión y falta de reconocimiento, deben demostrar que, a pesar de su juventud, son verdaderas heroínas. En su camino, las chicas aprenden importantes lecciones sobre la amistad, la confianza y el sacrificio.
Mientras la batalla por limpiar su nombre se intensifica, las Powerpuff Girls deben unir sus fuerzas y superar sus diferencias para enfrentarse a Mojo Jojo y salvar a la ciudad que las necesita. Con acción, humor y mensajes sobre la valentía, esta aventura no solo es una lucha contra el mal, sino también una exploración del crecimiento personal de estas tres encantadoras luchadoras. ¡Es hora de que el mundo vea de qué están hechas realmente!