En un tranquilo pueblo de Japón, donde la naturaleza y lo sobrenatural se entrelazan, un carismático joven llamado Takashi Natsume vive con el don de ver espíritus, un legado que heredó de su difunta abuela. Aunque ha luchado por encontrar su lugar en un mundo donde es difícil ser comprendido, su vida da un giro inesperado cuando empieza a cumplir sus promesas a los espíritus a quienes ha ayudado a lo largo de los años.
Un día, Natsume recibe la visita de un misterioso ser sobrenatural que desencadena una serie de eventos inquietantes. Con la ayuda de su fiel amigo el espíritu nekomata, Madara, comienza a investigar la naturaleza de este nuevo visitante y sus intenciones. A medida que Natsume profundiza en el misterio, descubre que este ser guarda secretos oscuros que afectan tanto a los espíritus como a los humanos.
Mientras la historia se despliega, nuestras emociones se ven llevadas a un viaje introspectivo que explora la amistad, la pérdida y la dificultad de aceptar el pasado. La película combina momentos de acción mágica con escenas emotivas que resaltan la belleza de las relaciones que Natsume ha forjado a lo largo de su viaje. Al final, será cuestión de valentía y lazos que trascienden los mundos humano y espiritual para salvar el equilibrio de su entorno.