En un mundo en ruinas, tras años de batallas y batallas emocionales, Shinji Ikari se enfrenta a sus miedos más profundos mientras busca su lugar en un universo desolado. La humanidad ha llegado a un punto de inflexión tras el Tercer Impacto, y los supervivientes deben lidiar con las secuelas de decisiones tomadas en el pasado. Shinji, atrapado entre el dolor y el deseo de conexión, comienza a cuestionar su propósito y la naturaleza de las relaciones que ha forjado a lo largo de su travesía.

En un mundo post-apocalíptico donde la humanidad está al borde de la extinción, los sobrevivientes luchan contra los ángeles, criaturas misteriosas que amenazan con arrasar lo que queda de la civilización. La historia se centra en Shinji Ikari, un joven piloto de mechas que despierta en un mundo desolado, tres años después de haber estado en un estado de suspensión. La realidad ha cambiado drásticamente; sus antiguos amigos y aliados están profundamente marcados por la guerra y desconfían de él.

En un futuro no muy lejano, la ciencia ha logrado desarrollar un dispositivo revolucionario que permite a las personas compartir y explorar sus sueños. Sin embargo, no todo es tan idílico; un grupo de científicos descubre que sus avances han caído en manos equivocadas. Un misterioso ladrón de sueños ha comenzado a manipular las pesadillas de los individuos, sumergiéndolos en un torbellino de caos y aflicción.