En el Salvaje Oeste, un veterano de la guerra, ya algo amargado, se encuentra con una misteriosa monja que no es lo que parece. Él es un hombre solitario que ha vivido lo suficiente para ser escéptico sobre la bondad humana, mientras que ella irradia una mezcla de fe y determinación. Al principio, él intenta mantener su distancia, pero cuando su camino se cruza con el de esta enigmática mujer, no puede evitar sentirse intrigado.

En un pequeño pueblo vasco, en plena Guerra Civil Española, la vida pacífica de sus habitantes se ve interrumpida por la llegada de tropas republicanas y franquistas que luchan por el control del lugar. La atmósfera se vuelve tensa y la división entre los que apoyan a la República y los que están a favor del régimen franquista se intensifica, llevando a los locales a tomar decisiones difíciles que no solo afectan su supervivencia, sino también sus relaciones personales.

Un joven llamado Juan Preciado llega al pueblo fantasma de Comala, guiado por la promesa que le hizo su madre en el lecho de muerte: encontrar a su padre, un hombre que ha vivido en sus historias como un ser casi mítico. Una vez en el desolado pueblo, Juan descubre que la realidad es muy distinta a lo que esperaba. Comala está habitada por almas en pena, susurros de un pasado repleto de dolor y desilusión, donde los vivos apenas pueden diferenciarse de los muertos.