En esta divertida y tierna secuela, la familia Newton vive una vida apacible con su amado San Bernardo, pero todo cambia cuando aparece una inesperada noticia: Beethoven va a ser papá. La historia comienza con la relación de la familia desbordando de alegría y travesuras, pero cuando Beethoven se encuentra con una hermosa perra llamada Brigitte, los problemas no tardan en llegar. Mientras Beethoven se dedica a conquistar el corazón de su nueva amiga, la casa se convierte en un caos total, especialmente cuando los cachorros, adorables y traviesos, hacen su gran entrada.
Sin embargo, la felicidad de la familia se ve amenazada por un villano inesperado: un siniestro criador de perros que está decidido a robar a los cachorros y utilizarlos para sus propios fines egoístas. La familia Newton se une a Beethoven y sus cachorros para proteger a los recién nacidos, desatando una serie de planes hilarantes y aventuras emocionantes. El viaje los lleva a situaciones absurdas y hilarantes, desde un concurso de mascotas hasta persecuciones desenfrenadas que hacen reír a carcajadas.
Al final, la lealtad y el amor de Beethoven y su familia se ponen a prueba, llevándolos a descubrir que la verdadera familia no se mide solo por la sangre, sino por los lazos que se construyen a través de momentos compartidos y nudos divertidos. Esta película es un recordatorio cálido y cómico de la importancia de la amistad y la familia, tanto humana como canina.