En un mundo donde la paz es frágil, las leyendas antiguas despiertan ante la inminente amenaza de un gigantesco monstruo. La historia comienza cuando un grupo de científicos descubre un misterioso huevo en una isla remota. Al poco tiempo, se revela que se trata de un símbolo de vida y destrucción: un larva de Mothra, una criatura mística que representa el equilibrio de la naturaleza. Pero el descubrimiento pronto despierta la furia de otra colosal bestia: Godzilla, el rey de los monstruos, que irrumpe en busca de alimento y caos.
Mientras las ciudades japonesas se convierten en escenario del enfrentamiento, Mothra se transforma en su forma adulta y vuela para enfrentarse a Godzilla. Sin embargo, la batalla no es solo una lucha por la supervivencia; refleja un conflicto más profundo entre la naturaleza y la destrucción que el hombre ha desatado en el mundo.
En medio del caos, dos gemelas que sirven como médiums de Mothra intentan comunicar el urgente mensaje de preservar el equilibrio ecológico. A medida que la lucha se intensifica, lo que inicialmente parece ser un combate entre titanes se convierte en una profunda reflexión sobre la responsabilidad humana de cuidar nuestro planeta. En un clímax explosivo, los destinos de Godzilla, Mothra y la humanidad se entrelazan, dejando a todos preguntándose: ¿realmente podemos dominar a la naturaleza, o seremos finalmente sus siervos?