En un Japón mágico y pintoresco, un joven llamado Kubo vive feliz con su madre en un pequeño pueblo. Su vida gira en torno a contar historias, ayudando a los habitantes del lugar con su habilidad para manipular la luz y la sombra gracias a su guitarra. Sin embargo, su mundo se ve desafiado cuando se reencuentra con un doloroso pasado que lo conecta con una familia de dioses y ancestros que buscan venganza. Atraído por su misteriosa herencia, Kubo debe enfrentarse a un antiguo mal que ha regresado a atormentar a su vida.
Cazado por dos poderosos espíritus, Kubo se embarca en una épica aventura junto a su fiel compañero, un escurridizo y divertido mono, y un guerrero diminuto llamado Beetle. Juntos deben reunir las piezas de una armadura mágica que pertenece a su padre, el legendario samurái Hanzo. En su viaje, se encuentran con criaturas fantásticas y enfrentan desafíos que ponen a prueba su valentía y amistad.
Mientras Kubo lucha para comprender su legado y acepta su verdadera identidad, también aprende valiosas lecciones sobre el amor, la memoria y la importancia de las historias. Con una animación stop motion impresionante y una banda sonora envolvente, esta fábula visualmente deslumbrante sorprende a través de su emotivo relato y destaca la lucha de un joven por descubrir su destino en un mundo lleno de magia y mitos.