En la bulliciosa ciudad de Nueva York, un joven llamado Peter Parker, un nerd que lucha por encajar en la vida del instituto, se convierte en el blanco del acoso escolar. Todo cambia cuando es mordido por una araña radiactiva durante una excursión científica, lo que le otorga asombrosos poderes, como la habilidad de trepar paredes, fuerza sobrehumana y un sentido arácnido que le advierte de peligros inminentes. Con estos nuevos poderes, Peter se encuentra en una encrucijada: usar sus habilidades para el bien o aprovecharse de ellas para beneficio personal.
Tras la desgarradora muerte de su querido tío Ben, que ocurre justo después de que Peter decide no actuar cuando tuvo la oportunidad de detener a un ladrón, el joven promete que nunca más se quedará de brazos cruzados. Con el peso de su responsabilidad, se convierte en el héroe que Nueva York necesita en su lucha contra el crimen. Mientras tanto, enfrenta desafíos personales, como su amor no correspondido por Mary Jane Watson, la chica de sus sueños, y su complicada relación con su mejor amigo, Harry Osborn, cuyo padre, Norman, oculta un oscuro secreto.
Cuando Norman se convierte en el letal Duende Verde, sus caminos chocan en una épica batalla que no solo pondrá a prueba las habilidades de Peter como Spider-Man, sino también sus valores y la lidiabilidad con la culpa y la pérdida. A medida que lucha por equilibrar su vida personal y su vida como héroe, Peter aprende que con grandes poderes vienen grandes responsabilidades.