En un pintoresco pueblo victoriento, bajo las calles adoquinadas, habita un grupo peculiar de criaturas conocidas como los Boxtrolls. Estas encantadoras pero incomprendidas criaturas se dedican a recoger basura y tesoros olvidados, mientras llevan cajas de cartón como su única vestimenta. Sin embargo, los temores de la comunidad los han llevado a considerarlos monstruos. Todo cambia cuando un niño humano llamado Eggs, que fue adoptado y criado por los Boxtrolls, se convierte en el inesperado héroe de esta historia.
Cuando el despiadado exterminador Archibald Snatcher, impulsado por su ambición y la promesa de pertenecer a la élite de la ciudad, lanza un ataque contra los Boxtrolls para erradicarlos de una vez por todas, Eggs decide actuar. Se une a Winnie, la audaz hija del alcalde, y juntos se embarcan en una emocionante aventura para salvar a sus amigos de las garras de Snatcher. En el camino, Eggs debe descubrir su verdadero lugar en el mundo, entre sus queridas criaturas de caja y la sociedad que lo rechazó.
Con giros inesperados, un humor ingenioso y un mensaje profundo sobre la aceptación y la amistad, esta historia revela que la verdadera valentía radica en abrazar la diferencia y cuestionar las normas establecidas. A medida que el valor de Eggs se pone a prueba, el destino de los Boxtrolls y el futuro del pueblo penden de un hilo, llevándolos a un desenlace épico y conmovedor que desafía las apariencias.