En un mundo donde la oscuridad y la desesperanza comenzan a tomar forma, las Tortugas Ninja, ese legendario cuarteto de guerreros mutantes, están pasando por tiempos difíciles. Luego de la derrota de su archienemigo Shredder, Leonardo se ha retirado a un entrenamiento solitario en América del Sur, convencido de que necesita aprender a ser un líder aún mejor. Mientras tanto, Donatello, Rafael y Michelangelo se han quedado en Nueva York, llevando una vida más normal entre los suburbios y los callejones, pero la nostalgia y la falta de propósito comienzan a desgastarlos.
Todo cambia cuando una amenaza antigua resurge: un misterioso fenómeno está abriendo portales a través de la ciudad, dejando escapar criaturas de otros mundos y caos generalizado. Además, un empresario con oscuros intereses está detrás de estos eventos, buscando liberar a guerreros ancestrales que podría usar para sus propios fines.
Las Tortugas, en un intento de reunirse y enfrentar la crisis, deben superar sus diferencias y volver a unir fuerzas. Junto a su eterna amiga April O’Neil y el genial maestro Splinter, el cuarteto se embarca en una aventura épica que los llevará a redescubrir no solo sus habilidades de combate, sino también los lazos de hermandad que los hicieron invencibles. Risas, acción y momentos emotivos se trenzan en este viaje que les enseñará que, a pesar de las adversidades, la unión siempre será su mayor fortaleza.